目前，南方科技大学2019年综合评价招生已全面启动，各地考生开始报名。报名截止日期为4月30日（上海、浙江为5月15日）。据悉，参加综合评价招生是入读南科大的唯一途径，必须提前在南科大招生网上注册报名，参加南科大自主能力测试，并且在提前批次第一志愿填报南科大。
有意向的考生需登录南科大招生网，了解招生政策。在南科大招生网报名系统注册、填写完整、真实、有效的信息，并上传报名材料。报名截止日期为4月30日（上海、浙江为5月15日）。南科大将组织专家组对考生的报名材料进行初评，5月中下旬完成审核，并公示通过初评的考生名单。通过初评的考生获得该校自主能力测试机试资格（通过初评的上海、浙江考生直接获得该校能力测试面试资格）。有意向的考生需参加2019年全国统一高考。然后参加该校自主能力测试。
值得注意的是，报考南科大的考生，须取得能力测试成绩并在高考提前批次第一志愿填报南科大。南科大在录取时按理工大类提前批次招生，具体专业分类仅为报考参考和基本程序，不影响入学之后的专业选择。
据了解，南科大采用"基于高考的综合评价录取模式"（又称"631"模式）开展本科招生，即高考成绩（折算成百分制）占综合成绩的60%，该校组织的能力测试成绩占30%（机试占25%、面试占5%；上海的面试成绩占30%；浙江进行综合素质测试，其中面试占27%，综合素质评价占3%），高中学业成绩占10%（3%为综合素质评价、7%由高中学业水平考试成绩折算；浙江的高中学业成绩全部由高中学业水平考试成绩折算），按考生综合成绩择优录取。若综合成绩相同，高考成绩高者优先录取；若综合成绩、高考成绩都相同，则该校能力测试成绩高者优先录取。
南科大按理工大类进行招生，实施“2+2”的本科生培养模式。本科新生入学后可在前两年不分专业，强化通识教育，打好学科基础，最早在大一下学期、最晚在大二下学期根据自身兴趣和特长自选专业。在“宽口径、厚基础”之上，优化专业教育，注重学科交叉。这样既可以规避考生填报志愿时盲目选择专业带来的风险，又使本科教育更加科学。专业课授课采用小班教学，本科生全面参与科研，坚持以研究引领教学，为培养高层精英人才奠定基础。
目前，南科大已与40多所境外知名大学在人才培养、教学科研等方面签署合作协议，设有20多个境外学习交流项目，学生可通过学期交流、短期交流、暑期实习等方式，前往如牛津大学、爱丁堡大学、利兹大学、伦敦国王学院、哥伦比亚大学、佐治亚理工学院、不列颠哥伦比亚大学、昆士兰大学、新加坡国立大学等海外名校学习。同时，南科大设立境外留学奖学金计划提供资助，确保每一名本科生大学期间都有机会出境或出国学习交流。
南科大设立有完善的奖助学金制度。2018年，计划全额资助高考成绩排名广西理科前200名的新生进入国外顶尖名校学习交流1年或给予20万人民币奖学金;给子高考成绩排名广西理科201-400名的新生每人奖励人民币10万元;给予高考成绩排名广西理科401-1000名的新生每人奖励人民币8万元。继续设立新生奖学金，覆盖面不低于70%，金额从3000元至5万元不等。在校学习期间，除国家奖学金、深圳大运奖学金外，南科大还设有大学生初创奖学金、招商银行奖学金和其它单项奖学金，以奖励在学术、社会服务和个人特长等方面有出色表现的学生。同时，为帮助南科大家庭经济贫困的学生顺利完成学业、提升自身素质，更加健康、全面的成长，学校设有包括国家助学金在内的多个助学金项目，额度为每生2000至10000元。对于临时出现经济困难的学生，还可获得临时困难补助。